Η κυβερνητική πολιτική και οι αποφάσεις της Ευρωπαϊκής Ένωσης έχουν μεγάλη επίδραση στα συστήματα του ΦΠΑ και στα τελωνειακά συστήματα τα τελευταία χρόνια. Τα ποσοστά και οι υποχρεώσεις αναφορικά με τους έμμεσους φόρους σε διάφορα Κράτη-Μέλη της Ευρωπαϊκής Ένωσης αλλάζουν συχνά και ο αριθμός των ελέγχων που γίνονται από τις φορολογικές αρχές σχετικά με το ΦΠΑ αυξάνονται. Αυτή η τάση είναι πιθανόν να συνεχίσει μέσω της είσπραξης από τις κυβερνήσεις περισσότερων εσόδων από τους έμμεσους φόρους, της εναρμόνισης της φορολογικής νομοθεσίας αναφορικά με τους έμμεσους φόρους εντός της Ευρωπαϊκής Ένωσης, της αύξησης του διεθνούς εμπορίου και της θέσπισης του ΦΠΑ από περισσότερες χώρες μη μέλη της Ευρωπαϊκής Ένωσης.